集装箱运输费用的单位价格称为集装箱运价。国际集装箱运价不是一个简单的价格金额，而是包括费率标准、计收办法、承托双方责任、费用、风险划分等的一个综合价格体系。

由于集装箱运输打破了“港到港”交接的传统，可以实现“门到门”的运输，使得承运人的运输路线增长，运输环节增多，运输过程中花费的成本构成也与传统运输有很大区别，而且由于以集装箱为运输单元，其计费方式也有了很大变化。

一、集装箱运费的基本结构

运输全程来看，集装箱运输产生之前，传统的件杂货运价是分方式、分段计算的。作为承担绝大部分国际运输的海运段运价，其结构是建立在“港到港”交接基础上的，仅包括货物的海上运费和船边装船、卸船费用，一般把这三项费用称为海运费。

在国际多式联运下，集装箱货物交接从港口向内陆延伸，交接地点延伸使运输经营人的责任和风险扩大到内陆港口、货运站、货主工厂或仓库等内陆地点，似的集装箱运费构成不仅包括海运运费，还包括内陆集疏运费、堆场服务费、货运站服务费、集装箱及设备使用费和港口中转费等。

1、海运运费包括基本运费和各种附加费，是集装箱运费收入的最主要部分。

2、港区服务费

（1）堆场服务费：或称码头服务费（THC），即装船港堆场接收出口的整箱货，以及堆存和搬运至装卸桥下的费用；卸货港包括装卸桥下接收进口箱及搬运至堆场和堆存的费用，还包括装卸港单证等费用。

堆场服务费可以在装卸港分别向收货人和发货人收取，也可在CY/CY条款下并入海运费，在某些国家以附加费形式计收。

（2）货运站服务费：指拼箱货（LCL）经由货运站作业时的各种操作费用，包括提还空箱、装箱、拆箱、封箱、做标记，在货运站内货物的正常搬运与堆存，签发场站收据、装箱单，必要的分票、理货与积载等费用。

就拼箱货的总费用，船公司可分海运费及拼箱服务费两部分分别收取，也可合并计收。

3、集疏运费也称转运费，指由发货地运往集装箱码头堆场或由集装箱码头堆场运往交货地的费用。经由水路和陆路的转运运费分别为：

（1）集散运输费：指将集装箱货物由收货地经水路（内河、沿海）运往集装箱码头堆场间的运费。

（2）内陆运输费：指经陆路（公路或铁路）将集装箱货物在港口与交货地之间的运费。采用陆路运输时，通常可由承运人或货主自行负责运输。如果由承运人运输，费用包括区域运费（空、重箱运费）、无效拖运费、变更装箱地点费、装箱时间延迟费及清扫费；由货主自行运输时，承运人通常根据协议将空箱出借给货主或将重箱交由货方自行负责拖运，费用仅包括集装箱装卸车费、超期使用费等。

二、集装箱运价的按箱计费

目前集装箱运输中，尽管有些国家在公路和铁路运输中仍沿用吨公里计价，但大多数国家对整箱货运输都用按箱计费的箱公里运价；在拼箱运输中，各国和地区采用的运价有区别，有的采用传统件杂货运价加附加费形式，有的采用以货物重量或体积为计费标准（即W/M费率）的运价。拼箱货运价一般都包含货物的装、拆箱及集装箱货运站费用。 世界上大多数班轮公司的集装箱的海运运价其整箱货一般都采用包箱费率（Box?Rates），这种包箱费率一般都包括集装箱的海上运费与在装、卸船港码头的装卸费用。
集装箱港口装卸费一般也是以箱为单位计收的，大多采用包干费形式（装卸包干费与中转包干费）。另外在运输全过程中，集装箱在起运地、中转地、终点堆场存放超过规定的免费堆存期时收取的滞期费一般也是按箱天数计收的。

三、集装箱海运运费计算

国际海运运价大体可以分为两种类型：不定期船运价和班轮运价。其中，前者的费率水平随航运市场的供求关系而波动。在市场繁荣时期，不定期船运费率就会上涨；在市场不景气时，就会随之下跌。后者由班轮公会和班轮经营人确定，它们多与经营成本密切相关，在一定时期内保持相对稳定。
集装箱货物海运运价计算办法与普通班轮运费的计算办法一样，也是根据运价本规定的费率和计费办法计算运费，并同样也有基本运费和附加费之分。

目前集装箱货物运价基本上分为两大类：一类沿用件杂货运费计算方法，以每运吨（W/M）为计算单位，加上相应的附加费；另一类是以箱为计算单位，按航线包箱费率计算。前一类计算方法对拼箱货运输较为合适，后一类对整箱货运输较为合适。